A Reitoria é o órgão executivo que superintende e coordena as atividades da Universidade.
É exercida pelo reitor, nomeado com o vice-reitor pelo chanceler, arcebispo de Porto Alegre, a partir de lista tríplice apresentada pela Mantenedora, para um mandato de quatro anos, com a possibilidade de recondução para um novo mandato.
Para auxiliar o Reitor no exercício de suas tarefas executivas, a Universidade dispõe de quatro Pró-Reitorias.
A Reitoria dispõe ainda dos seguintes órgãos:
