A administração da Universidade é realizada por órgãos deliberativos e executivos, ocorrendo em dois níveis – de administração superior e de unidades acadêmicas.
A Administração Superior da Universidade conta com a Reitoria como órgão executivo que tem entre suas funções a administração e a coordenação das atividades da Universidade. Para isso dispõe das Pró-Reitorias de Administração e Finanças, de Graduação e Educação Continuada, de Pesquisa e Pós-Graduação, de Extensão e de Assuntos Comunitários, bem como dos órgãos de Assessorias de Comunicação e Marketing, de Cooperação Internacional e de Planejamento e Avaliação, além da Procuradoria Jurídica e de assessores especiais.
