O setor de Paleontologia do Museu de Ciências e Tecnologia da PUCRS desenvolveu-se a partir da década de 1970, através de intensa coleta de fósseis. O acervo paleontológico possui grande representatividade das formas fósseis ocorrentes no sul do Brasil, principalmente da região central do Rio Grande do Sul, que foram objeto de várias publicações, teses e dissertações no Brasil e no exterior. As atividades do setor envolvem a organização, guarda e conservação deste acervo, bem como de seu crescimento, através de expedições de coletas. A infraestrutura existente permite a preparação e estudo dos fósseis no setor e, eventualmente, sua divulgação na exposição publica do museu.