Neste setor são desenvolvidas atividades de curadoria da coleção e de pesquisas nas áreas de Taxonomia, Filogenia e Biogeografia de peixes neotropicais e marinhos. Tais atividades são realizadas pelos integrantes do setor, profissionais da Universidade, e pelos alunos do pós-graduação em Zoologia, níveis de mestrado e doutorado, da Faculdade de Biociências. Alunos de graduação do curso de Ciências Biológicas também atuam em projetos de pesquisa e no auxilio ao gerenciamento da coleção científica.