O Herbário iniciou a sua coleção com 572 exemplares  vegetais coletados no período de 1941 a 1960. Atualmente está dividido em subcoleções de ramos, frutos, sementes, fungos, liquens, algas e madeiras, conservados em ambientes tratados e climatizados. Uma coleção considerável que serve principalmente como fonte de informação ao conhecimento da flora do Rio Grande do Sul, contribuindo no valor qualitativo e na distribuição das espécies no espaço e no tempo.

GRUPOS	TOTAIS
ALGAS	326
FUNGOS	114
LIQUENS (FUNGOS LIQUENIZADOS)	1.667
BRIÓFITAS	31
PTERIDÓFITAS	450
ANGIOSPERMAS	9.026
GYMNOSPERMAS	18
TOTAL CATALOGADAS	11.636
A INCORPORAR	1.200
TOTAL GERAL	12.836

        Distribuídos em  sete (7) coleções:

        Carpoteca (frutos), Espermoteca (sementes), Ficoteca (algas), Herbário (exsicatas = plantas dissecadas),  Liquenoteca (liquens), Micetoteca (fungos) e  Xiloteca (madeiras).

        O acervo científico abrange 98% da vegetação dos estados do Rio Grande do Sul e Santa Catarina, com representante das seguintes formações: Floresta Estacional Semi-Decidual, Floresta Estacional Decidual, Campos de cima da serra e áreas de Tensão Ecológica de Porto Alegre e cidades da Grande Porto Alegre.

        ANGIOSPERMAS: Grupo sistemático que contém o maior número de plantas colecionadas no acervo, destacando-se neste as famílias POACEAE, com 245 espécies e ASTERACEAE, com 231

        PTERIDÓFITAS: Grupo representado por 20 famílias, 65 gêneros e 156 espécies.

        LIQUENS (FUNGOS LIQUENIZADOS): É o terceiro maior grupo na coleção, constando de 22 famílias, 37 gêneros e 118 espécies.

        03 isótipos, 01 parátipo.

        Estando o Herbário MPUC localizado no Rio Grande do Sul, automaticamente é favorecido com a grande diversidade de vegetais encontrados neste Estado, coletados a partir de 1941, testemunhando no espaço e no tempo a riqueza da flora local e portanto, valorizando o acervo científico do herbário.

        A coleção é formada por vegetais oriundos de diversos locais, como os que sofreram impactos ambientais, e cujas floras foram substituídas por construções, por exemplo: as Hidrelétricas de Machadinho - RS, SC; Itá – SC; Campos Novos - SC e Garabi, entre Brasil e Argentina.

        Parte dos exemplares colecionados constituem uma coleção histórica que marca o início do Herbário, coletados entre 1941 a 1960. Outros especimes de vegetais são representantes de invasores da cultura de arroz irrigado do RS, de valor econômico, endêmico e raro e representantes da flora do Centro de Pesquisas e Conservação da Natureza - PRÓ-MATA , em São Francisco de Paula - RS.

        No acervo dos LIQUENS (FUNGOS LIQUENIZADOS), 50% dos espécimes foram coletados em regiões sob impacto ambiental, na região de construção de hidrelétricas, principalmente ocorrentes no Rio Grande do Sul. São neste caso um referencial de grande importância para o estado; 25% do acervo representam material coletado em floresta de pinhais, principalmente no PRO-MATA e 25% em outros municípios.