Laboratório de Pesquisa em Ciências Aeronáuticas
O Laboratório de Pesquisa em Ciências Aeronáuticas tem como objetivo a produção de conhecimento na aviação, contemplando as seguintes linhas de pesquisa:
(1) Fatores humanos e prevenção de acidentes, incluindo temáticas como gestão de crises, engenharia de resiliência; interação humano-máquina; sistemas de gestão de segurança; prevenção e investigação de acidentes; prevenção e investigação de erro humano; fenômenos e atividades macrocognitivas; treinamento e limitações da performance humana; prevenção de acidentes no uso de tecnologias aeroespaciais; engenharia de sistemas cognitivos e sistemas cognitivos correlacionados.
(2) Gestão do transporte aéreo, incluindo as temáticas Estratégia em Transporte Aéreo; Planejamento e Organização de Empresa Aérea; História da Aviação.
(3) Língua, aviação e a prevenção de acidentes em sistemas tecnológicos complexos, com foco no desenvolvimento, implementação e disponibilização de ferramentas informatizadas para a gestão de crises, prevenção e investigação de acidentes, prevenção e investigação de erro humano.

Laboratório de Engenharia Biomédica Aeroespacial
Este laboratório tem como principal objetivo pesquisar, conceber, projetar e desenvolver ferramentas, equipamentos e sistemas necessários para a realização de estudos biomédicos no ambiente aeroespacial e em suas simulações em terra.

Laboratório de Fisiologia Aeroespacial - John Ernsting
Este laboratório, um dos primeiros do Centro de Microgravidade, tem como objetivos o estudo do funcionamento do organismo humano no ambiente aeroespacial e da adaptação do ser humano em ambientes extra-terrestres (como Lua e Marte). Para atingir esses objetivos, o Laboratório realiza estudos em simulação de hipergravidade, microgravidade, desorientação espacial e hipóxia. Profissionais deste laboratório participaram de duas campanhas de vôos parabólicos da Agência Espacial Européia (ESA).

Laboratório de Farmácia Aeroespacial - Joan Vernikos
O Laboratório de Farmácia Aeroespacial, criado através de uma parceria com a Faculdade de Farmácia, tem como objetivos: a pesquisa dos medicamentos da forma farmacêutica ao material de acondicionamento e embalagem em condições que simulem microgravidade e radiações durante vôos aeroespaciais; a realização de pesquisas referentes ao efeito da hipergravidade simulada sobre a germinação e produção de metabólitos secundários em plantas medicinais; realização de estudos relacionados ao efeito de medicamentos na cinetose espacial.

Laboratório de Telessaúde
O Laboratório de Telessaúde tem como intuito expandir as fronteiras da saúde por meio da aplicação de novas tecnologias de comunicação e informática na prática dessa área do conhecimento. Para tanto, o laboratório desenvolve projetos multidisciplinares e interinstitucionais, os quais se dividem em três subáreas: educação, pesquisa e assistência. Graças às colaborações nacionais e internacionais estabelecidas na área de eHealth, firmou-se convênios com instituições de ensino e pesquisa européias, americanas, asiáticas e africanas.

Laboratório de Pesquisa em Biomecânica Aeroespacial - Nuba
O NUBA desenvolve pesquisas científicas voltadas, especialmente, a estudos na área de Biomecânica e Fisiologia do Exercício no ambiente aéreo, espacial (estação espacial, naves espaciais e ambientes extra-terrestres) e suas simulações em Terra.

Laboratório de Pesquisa em Fisioterapia Aeroespacial - Nufa
A criação de um Laboratório de Fisioterapia, em parceria com a Faculdade de Enfermagem, Nutrição e Fisioterapia, dentro da área Aeroespacial teve como objetivo incentivar a contribuição de profissionais desta área do conhecimento nas pesquisas referentes à adaptação do ser humano ao ambiente aeroespacial e sua readaptação à Terra (reabilitação física pós-vôo). Estudos relativos à ergonomia em aeronaves também fazem parte do scope deste laboratório.

Laboratório de Imagem - Labima
O Laboratório de Imagens (Labima) tem como objetivo a pesquisa e desenvolvimento de processos e equipamentos com ênfase em Engenharia Biomédica bem como soluções aplicadas à Telemedicina. Este laboratório tem como atividades pesquisar, conceber, projetar e desenvolver ferramentas, em hardware e software, para utilização médica aplicável.